Dall'istituzione del rettore unico, nel 1806

1806-1807: Giuseppe Antonio Bonato
1807-1808: Daniele Francesconi
1808-1809: Francesco Maria Franceschinis
1809: Luigi Mabil
1809-1810: Pietro Sografi
1810-1811: Giacomo Giuliani
1811-1812: Antonio Collalto
1812-1813: Stefano Gallini
1813-1814: Antonio Marsand / Giacomo Giuliani / Luigi Lanfranchi
1814-1816: Francesco Maria Franceschinis
1816-1817: Angelo Dalla Decima
1817-1818: Giovanni Giuseppe Cappellari
1818-1819: Antonio Marsand
1819-1820: Giuseppe Antonio Bonato
1820-1821: Felice Dianin
1821-1822: Giovanni Battista Zandonella
1822-1823: Antonio Meneghelli
1823-1824: Francesco Fanzago
1824-1825: Giovanni Santini
1825-1826: Sebastiano Melan
1826-1827: Alessandro Racchetti
1827-1828: Stefano Gallini
1828-1829: Salvatore Dal Negro
1829-1830: Tommaso Fidenzio De Grandis
1830-1831: Giovanni Giuseppe Cappellari
1831-1832: Girolamo Molin
1832-1833: Jacopo Bonfadini
1833-1834: Agnolo Valbusa
1834-1835: Giovanni Cicogna
1835-1836: Floriano Caldani
1836-1837: Luigi Configliachi
1837-1838: Stefano Agostini
1838-1839: Antonio Valsecchi
1839-1840: Rodolfo Lamprecht
1840-1841: Giovanni Petrettini
1841-1842: Giovanni Francesco Fannio
1842-1843: Carlo Augusto Bazzini
1843-1844: Tommaso Antonio Catullo
1844-1845: Lodovico Menin
1845-1846: Giuseppe Onorio Marzuttini
1846-1847: Sebastiano Melan
1845-1846: Giuseppe Onorio Marzuttini
1846-1847: Sebastiano Melan
1847-1848: Giuseppe Torresini
1848-1849: Vittorio de La Casa
1849-1850: Baldassare Poli
1850-1852: Luigi Configliachi
1852-1856: Giuseppe De Menghin
1856-1857: Giovanni Santini
1857-1858: Lodovico Menin
1858-1859: Vincenzo Fabeni
1859-1860: Francesco Panella
1860-1861: Giovanni Cicogna
1861-1862: Raffaele Serafino Minich
1862-1863: Lodovico Menin
1863-1864: Tito Vanzetti
1864-1865: Francesco Panella / Domenico Colauzzi
1865-1866: Giovanni Battista Pertile
1866-1867: Giusto Bellavitis
1867-1868: Giuseppe De Leva
1868-1869: Francesco Marzolo
1869-1870: Giampaolo Tolomei
1870-1871: Domenico Turazza
1871-1872: Giacomo Zanella
1872-1873: Ferdinando Coletti
1873-1879: Giampaolo Tolomei
1879-1880: Francesco Marzolo
1880-1882: Emilio Morpurgo
1882-1885: Giuseppe De Leva
1885-1891: Giampaolo Vlacovich
1891-1896: Carlo Francesco Ferraris
1896-1900: Achille De Giovanni
1900-1905: Raffaele Nasini
1905-1910: Vittorio Polacco
1910-1913: Vittorio Rossi
1913-1919: Ferdinando Lori
1919-1926: Luigi Lucatello
1926-1927: Emilio Bodrero
1927-1929: Emanuele Soler
1929-1932: Giannino Ferrari Dalle Spade
1932-1943: Carlo Anti 
1943: Concetto Marchesi
1943-1945: Giuseppe Gola
1945-1947: Egidio Meneghetti
1947-1949: Aldo Ferrabino
1949-1968: Guido Ferro
1968-1972: Enrico Opocher
1972-1984: Luciano Merigliano
1984-1987: Marcello Cresti
1987-1993: Mario Bonsembiante
1993-1996: Gilberto Muraro
1996-2002: Giovanni Marchesini
2002-2009: Vincenzo Milanesi
2009-2015: Giuseppe Zaccaria
2015-2021: Rosario Rizzuto
2021-...: Daniela Mapelli